Koko, được Zarudo nuôi dưỡng trong rừng, khám phá thế giới loài người cùng Satoshi và Pikachu. Cậu phát hiện một âm mưu nguy hiểm, đe dọa ngôi nhà tự nhiên của mình, buộc cậu phải hành động để bảo vệ.