Để chứng minh mình là anh hùng, Sonic cùng Tails phiêu lưu khắp thế giới tìm Ngọc Lục Bảo. Họ phải ngăn chặn Tiến sĩ Robotnik và Knuckles, cùng một cộng sự mới, chiếm lấy viên ngọc hủy diệt, bảo vệ nền văn minh khỏi hiểm họa.