Phần 2 đẩy cao trào lên mức đỉnh điểm khi Gotham khám phá **nguồn gốc** và **tiểu sử** của các **Super Villains** như **The Riddler**, **The Joker** và **Mr. Freeze**. Đồng thời, **Bruce Wayne** cũng vén màn nhiều **bí mật** về quá khứ của cha mình.

Gotham kể về Jim Gordon khởi nghiệp tại Sở cảnh sát Gotham. Vụ án đầu tiên của ông là vụ sát hại vợ chồng tỷ phú Wayne. Từ đó, Gordon gặp gỡ Bruce Wayne, người sau này trở thành Kỵ sĩ Bóng đêm, cùng ông chống tội phạm.