Sau chia tay Pha, Wayu được Mark quan tâm. Mark định theo đuổi Kit y khoa. Ngày đầu Mark theo đuổi, Pha muốn gặp Wayu nhưng cả hai đều thất vọng. Wayu dần chấp nhận cuộc sống mới, khuyến khích Mark theo đuổi Kit lần nữa, và họ cho nhau cơ hội. Khi mọi thứ tốt đẹp, Pha trở lại.

**Gen Y The Series Phần 2** khám phá nhiều mối quan hệ phức tạp: Pha và Wayu đối mặt với hậu quả chia tay, trong khi Wayu vội vàng hẹn hò với Thanu. Kit và Mark vật lộn với khoảng cách, dẫn đến tạm dừng. Pok nỗ lực vì Tong nhưng cảm thấy thất vọng, còn Tong hiểu lầm ý định của Pok. Phần này hứa hẹn nhiều **sóng gió** và **mâu thuẫn tình cảm** cho các nhân vật.