Trong Thế chiến II hư cấu, Trung tá Yuki thành lập trường đào tạo gián điệp “D Kikan”. Kato, một người lính bị kết án tử hình, được chiêu mộ và huấn luyện khắc nghiệt, sau đó nhận nhiệm vụ đầu tiên. Anh thâm nhập một thành phố quốc tế để lấy “Black Note” của đại sứ Mỹ. Một cuộc chiến khốc liệt giành “Black Note” nổ ra giữa Kato, Rin, tình báo Anh, Liên Xô và quân đội Nhật Bản.